Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms