Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCTD13Q8WZ19 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms