Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms