Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD1Q8NBU5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms