Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms