Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDDC3Q8N4P3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDDC3Q8N4P3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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