Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms