Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYT9Q86SS6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms