Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1DP3Q658K8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms