Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNT1Q5JUK3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms