Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL22Q53GT1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms