Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC38Q502W7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms