Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LETM2Q2VYF4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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