Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms