Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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