Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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ECM1Q16610 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECM1Q16610 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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