Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FXNQ16595 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FXNQ16595 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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