Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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