Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CSRP2Q16527 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms