Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIP13Q15645 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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