Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SYCP1Q15431 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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