Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRF4Q15306 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms