Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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