Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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