Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCLQ13371 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms