Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF6Q13247 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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