Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms