Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP4Q13115 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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