Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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