Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM32Q13049 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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