Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXD4Q12950 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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