Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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