Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms