Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RBBP4Q09028 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms