Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms