Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms