Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEUP1Q05D60 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms