Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms