Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms