Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms