Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HBBP68871 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms