Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB4BP68371 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms