Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HERVK_113P63121 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms