Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms