Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms