Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ME1P48163 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms