Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXD12P35452 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HOXD12P35452 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD12P35452 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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