Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBP1P32455 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBP1P32455 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms