Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFNP31947 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFNP31947 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFNP31947 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms