Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms